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印度基因组学研究所选用惠普超级计算机


http://www.sina.com.cn 2005年05月25日 13:35 新浪科技

  惠普近日宣布,位于印度新德里的一家实验室所属的基因组学与综合生物学研究所(IGIB)选择了可以执行4万亿次运算的基于Linux操作系统的惠普超级计算机,由此大力提升了生物学研究需要的生命科学计算能力。

  IGIB的超级计算机将成为亚洲最强大的惠普超级计算机,同时将使IGIB与西北太平洋国家实验室、匹兹堡超级计算中心、桑地亚(Sandia)国家实验室和Los Alamos国家实验室
等配备了惠普超级可扩展、能执行上万亿次运算的超级计算系统的实验室一样,成为世界一流的研究机构。

  IGIB致力于对生命科学和生命体系技术(life systems technology)相关知识的探索和发展,其科学研究覆盖基因、蛋白质、生物工艺学、药物与个体化医疗等。由于研究涉及的范围非常广泛,不仅只包括基因学,所以研究所需要借助采用XC系统软件的新的惠普集群平台超级计算机,来满足日益增长的复杂生命科学计算要求。

  IGIB主管Samir Brahmachari博士谈到:“惠普的集群平台可以提供一个可扩展的体系结构,使我们能够在更短时间内完成大型、复杂的模拟实验,例如:分子交互与动力学实验、药物虚拟筛选、蛋白质折叠等。此项技术集合了惠普在生命科学的丰富经验和专业知识,能够帮助IGIB更加迅速地获得信息和知识,并且实现更高工作效率。我们希望我们的研究工作能取得更大突破,研制出具有良好治疗效果的新药物和用于预先检测出人身体中复杂和无序的药物元素,并且最大程度地减少这些药物的副作用。”

  这款超级计算机能够提供4万亿次运算的强大性能,是具有288个节点的HP Cluster Platform 3000,其基于采用英特尔? 至强?处理器的HP ProLiant服务器,运行带XC系统软件的Linux系统。计算机采用10GB/秒的高速InfiniBand集群互连,同时惠普的XC系统软件能够提供出色的集群管理功能。

  惠普高性能计算部门副总裁兼总经理Winston Prather说:“通过与惠普合作来加速医学信息的获取,IGIB现在拥有了更快的创新速度,节省了大量资金,提高了工作效率,同时还能对新的机会和变化给予更迅速的响应。”

  IGIB中心还将拥有一个运行Linux的24节点高性能HP ProLiant集群及一台功能强大的HP Integrity Superdome服务器,该服务器将用于实验项目。系统由12TB的HP StorageWorks企业虚拟阵列5000存储和一个HP StorageWorks MSL6060磁带库提供支持。

  惠普技术在生命科学研究机构(例如新加坡的生物信息学研究所)中发挥了关键作用。惠普健康与教育行业全球副总裁Jeffrey D. Miller表示:“今天的发布再一次证明了惠普在推动生命科学创新方面处于业界领先地位,我们致力于与研究人员及产品开发商合作,从而加速获得新发现和新的治疗方法。”

  惠普集群平台与XC系统软件是惠普统一集群组合(Unified Cluster Portfolio)(2004年11月发布)的一部分,能够帮助客户管理计算生物学所产生的大量数据并实现其虚拟化。统一集群组合能够在多个操作系统(HP-UX、Microsoft Windows?及Linux)和基于行业标准处理器的服务器(英特尔至强、英特尔安腾?及AMD Opteron?)上共同实施。开放的标准平台使IGIB可以研究复杂的生物信息学算法,易于被全球领先研究机构轻松共享,并且能够与这些研究机构进行协作。



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