在尽量扩大北京各高校招生规模的基础上，高校的科研工作也在2003年得到了迅速发展。据统计，2001年，北京地区高校科研经费投入为30.65亿元，2002年达到了39.96亿元，增幅30.38%；市属市管高校科研经费增幅更大，2002年比2001年科研经费增加了1.8亿元，增幅达到了65.45%。根据预计，2003年北京高校科研经费将继续保持高速增长，北京地区高校科研经费预计可达到52亿元，市属市管高校科研经费预计可达到6.5亿元。

　　近三年来，北京高校科研成果丰硕，其中2001年获得374项省部级以上奖励，2002年获得626项省部级以上奖励；市属市管高校2001年获得41项省部级以上奖励，2002年获得80项省部级以上奖励。2003年，北京高校预计获奖数可达到980项，市属市管高校可达到120项。

　　2003年10月，经过科技部、教育部组织的专家验收，北京理工大学科技园、北京航空航天大学科技园、北师大-北中医科技园、北京邮电大学科技园被批准为“国家大学科技园”。目前，北京地区高校已有国家大学科技园6家，国家大学科技园建设单位1家，北京市大学科技园7家，国家大学科技园已占全国总数的六分之一。

　　北京市十分重视大学科技园的建设，专门成立了北京市大学科技园工作指导委员会，负责北京市大学科技园的建设以及组织国家大学科技园的申报工作，为北京市大学科技园申请国家大学科技园奠定了良好的基础。

　　截止到2002年底，北京市认定的12家大学科技园已累计投入资金11亿元(其中社会资金占95%)，建筑面积达52万平方米(其中校外23万平方米)，入园企业已达335家，其中101家孵化企业，70家获得高新技术企业认定，56家企业为师生创办；入园企业从业人数合计8000多人，其中引进国际专家11人，留学归国人员33人，外省市人才512人；入园企业2001年技工贸总收入33.3亿元，上缴税费3.3亿元，出口创汇125万美元。北京市大学科技园在北京郊区县、开发区合作或买地建园，带动了区域创新创业的环境建设和经济发展，产生了较好的扩散效应，显现了朝气蓬勃的新气象。