1956年我国成立了第一个计算机科学专门研究机构。
至1999年底，共取得科技成果479项，奖励184项（国家级26项，院部级136项）；我国第一台小型通用数字计算机103机就诞生在这里（1958年），及104机、107机、119机、曙光一号、曙光3000，曙光4000L等一系列具有里程碑意义的计算机。
从计算所陆续分离出：中科院微电子所、中科院计算中心、中科院软件所、中科院网络中心。